Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01679 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01679 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01679 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01679 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01679 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01679 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01679 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01679 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01679 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01679 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01679 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01679 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01679 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01679 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01679 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01679 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01679 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms