Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01665 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01665 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01665 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01665 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01665 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01665 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01665 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01665 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01665 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01665 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01665 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms