Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01650 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01650 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01650 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01650 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01650 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01650 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01650 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01650 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01650 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01650 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01650 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms