Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopeO89079 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopeO89079 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopeO89079 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopeO89079 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopeO89079 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopeO89079 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CopeO89079 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CopeO89079 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CopeO89079 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CopeO89079 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CopeO89079 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CopeO89079 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CopeO89079 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopeO89079 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopeO89079 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopeO89079 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms