Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnpda1O88958 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms