Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

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Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp2O88623 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp2O88623 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp2O88623 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms