Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms