Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capns1O88456 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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