Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Tnnt1O88346 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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Tnnt1O88346 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Tnnt1O88346 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Tnnt1O88346 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Tnnt1O88346 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Tnnt1O88346 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnt1O88346 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms