Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cfdp1O88271 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
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