Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms