Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pknox1O70477 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pknox1O70477 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms