Protein–RNA interactions for Protein: O70400

Pdlim1, PDZ and LIM domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim1O70400 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim1O70400 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim1O70400 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim1O70400 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim1O70400 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim1O70400 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim1O70400 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim1O70400 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim1O70400 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim1O70400 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim1O70400 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdlim1O70400 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms