Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms