Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms