Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Top3aO70157 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Top3aO70157 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Top3aO70157 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Top3aO70157 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Top3aO70157 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Top3aO70157 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top3aO70157 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top3aO70157 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms