Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms