Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif6O55135 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms