Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Copb2O55029 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms