Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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BckdkO55028 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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BckdkO55028 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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BckdkO55028 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdkO55028 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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