Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6bO54951 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6bO54951 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms