Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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EomesO54839 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EomesO54839 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EomesO54839 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EomesO54839 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EomesO54839 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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EomesO54839 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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EomesO54839 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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EomesO54839 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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EomesO54839 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EomesO54839 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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EomesO54839 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EomesO54839 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EomesO54839 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EomesO54839 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EomesO54839 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EomesO54839 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EomesO54839 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EomesO54839 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EomesO54839 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EomesO54839 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EomesO54839 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EomesO54839 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EomesO54839 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EomesO54839 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EomesO54839 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EomesO54839 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EomesO54839 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EomesO54839 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EomesO54839 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EomesO54839 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EomesO54839 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EomesO54839 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms