Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DffbO54788 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DffbO54788 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms