Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms