Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FxnO35943 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FxnO35943 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FxnO35943 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FxnO35943 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FxnO35943 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FxnO35943 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FxnO35943 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FxnO35943 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FxnO35943 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FxnO35943 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FxnO35943 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FxnO35943 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FxnO35943 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FxnO35943 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FxnO35943 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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