Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nek2O35942 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nek2O35942 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Nek2O35942 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Nek2O35942 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Nek2O35942 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nek2O35942 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nek2O35942 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms