Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1baO35930 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms