Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms