Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phox2bO35690 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phox2bO35690 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phox2bO35690 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phox2bO35690 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms