Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scamp3O35609 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scamp3O35609 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms