Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms