Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf5O35326 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms