Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NmiO35309 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NmiO35309 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NmiO35309 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NmiO35309 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NmiO35309 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms