Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn9O35239 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms