Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Nedd9O35177 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Nedd9O35177 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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