Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casq1O09165 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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