Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EllO08856 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EllO08856 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
EllO08856 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
EllO08856 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EllO08856 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
EllO08856 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EllO08856 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms