Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra2O08842 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms