Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms