Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf6O08584 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf6O08584 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf6O08584 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf6O08584 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms