Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22bO08547 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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