Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccer2J3QPU5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.5 ms