Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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