Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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