Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17577J3QNF7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms