Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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