Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

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Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2bJ3QMK1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2bJ3QMK1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2bJ3QMK1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2bJ3QMK1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2bJ3QMK1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2bJ3QMK1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2bJ3QMK1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sgo2bJ3QMK1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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