Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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