Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm20828J3KMI7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm20828J3KMI7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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