Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms